Anaconda的基本使用 - 迷途小书童的Note迷途小书童的Note

文章目录

软硬件环境

ubuntu 16.04 64bit
Anaconda 3.5.1.0
python 3.6

Anaconda是什么

Anaconda 是一个用于科学计算的 python 发行版，支持 Windows, Linux 及 Mac 系统，提供了包管理的功能，可以非常方便的解决 python 的多版本并存,切换及各种第三方包的安装问题，并且还能独立于系统环境，添加及删除都非常方便。

安装配置

linux 版本的下载地址, https://www.anaconda.com/download/#linux，目前提供了分别基于 python2.7 和 python3.6 的2个正式版,最近 python 官方已经有消息称 python2 只会支持到2020年,所以如果没有特别的原因,请尽早迁移到 python3。下载好的是一个脚本文件 Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh,然后执行

./Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh

安装过程基本上是傻瓜式的，不过有3点需要注意，第一默认的安装路径在 /home/$user/anaconda3，第二就是执行安装脚本时不要用 sudo，这样做的好处是减少系统权限问题，管理方便，迁移方便，第三将 PATH 加入 ~/.bashrc 中，如果安装过程中不小心选择了 NO，自行添加也可以，如下

export PATH=/home/xugaoxiang/anaconda3/bin:$PATH

conda命令

安装完 anaconda，conda 命令就有了, 它是一个工具，可以在命令行中执行，与 pip 的使用非常类似，用来进行包管理及环境管理。

这里列几个 conda 的常用命令

# 查看当前环境下已安装的包
conda list

# 查看某个指定环境的已安装包
conda list -n python36

# 查找package信息
conda search numpy

# 安装package
conda install numpy

# 更新package
conda update numpy

# 删除package
conda remove numpy

# 更新conda, conda也是一个package
conda update conda

# 更新python
conda update python

# 创建虚拟环境
conda create -n test python=3.6

# 删除虚拟环境
conda remove -n test --all

# 查看所有创建的虚拟环境
conda env list

# 激活虚拟环境
conda activate test

# 退出虚拟环境
conda deactivate

# 虚拟环境克隆
conda create -n target --clone source

anaconda源管理

国内比较好的 anaconda 源，清华大学的，把它添加进来

编辑 ~/.condarc 文件

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
channel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

然后执行命令 conda clean -i 清理索引缓存

如果在创建虚拟环境时出现下面类似错误

Collecting package metadata (current_repodata.json): failed

ProxyError: Conda cannot proceed due to an error in your proxy configuration.
Check for typos and other configuration errors in any '.netrc' file in your home directory,
any environment variables ending in '_PROXY', and any other system-wide proxy
configuration settings.

可以将上述 .condarc 文件中的 https 改为 http，然后再次尝试，可以参考官网讨论 https://github.com/conda/conda/issues/9497

pycharm中使用anaconda

依次打开 File --> Default Settings --> Project Interpreter，新增本地的 python 解析器, 在出现的对话框中左侧选中 Conda Environment, 对应的右侧 pycharm 会自动帮你找到 anaconda 中安装的 python 位置,你可以给它取个好记点的名字，如我这的 /home/xugaoxiang/anaconda3/envs/xugaoxiang，版本号是3.6，点击 Apply,再选中 OK 完成配置。

在上述步骤结束之后，可以到 /home/xugaoxiang/anaconda3/envs/ 目录下看看，在配置之前这个目录是空的，现在多处了很多的文件及目录，它是一个独立的虚拟环境

升级python

执行命令 conda update python，升级完成后，发现执行 python 时报错

  File "C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\requests\__init__.py", line 43, in <module>
    import urllib3
  File "C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\urllib3\__init__.py", line 7, in <module>
    from .connectionpool import HTTPConnectionPool, HTTPSConnectionPool, connection_from_url
  File "C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\urllib3\connectionpool.py", line 39, in <module>
    from .response import HTTPResponse
  File "C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\urllib3\response.py", line 155, in <module>
    class HTTPResponse(io.IOBase):
  File "C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\urllib3\response.py", line 377, in HTTPResponse
    DECODER_ERROR_CLASSES += (brotli.error,)
AttributeError: module 'brotli' has no attribute 'error'

将 C:\Users\admin\anaconda3\lib\site-packages\urllib3\response.py 文件中的

if brotli is not None:
    DECODER_ERROR_CLASSES += (brotli.error,)

改为

#if brotli is not None:
#    DECODER_ERROR_CLASSES += (brotli.error,)

然后执行 conda update conda，urllib3 软件包也随之升级，问题解决

虚拟环境中更改python版本

某些时候，已经创建好了对应的虚拟环境，也已经安装了部分依赖库，这时，发现 python 版本不兼容(比如需要3.7版本，而创建的环境是3.8)，如果重新创建虚拟环境，就太麻烦了，可以这样

conda activate test
conda install python=3.7

参考资料

https://www.anaconda.com/